La iglesia de San Nicolás fue construida en la primera mitad del siglo XVIII por el los Dientzenhofer, tanto padre como hijo, en estilo arquitéctonico de la época del barroco cumbre. Suele ser señalado como la más bonita construcción del barroco checo, tanto desde el punto de vista arquitectónico como de la decoración artística de su interior.
La amplia nave principal del santuario acaba con una espaciosa cúpula con una altura de 50 metros (se trata del más alto espacio interior en Praga) y por fuera alcanza unos ochenta metros.
En la suntuosa decoración interior destaca el fresco sobre la nave principal, obra de J. L. Kracker , con el motivo de San Nicolás, que con su extensión de unos 1500 pertenece a una de las más grandes de Europa. Las esculturas de tamaño sobrenatural de F. Platzer y las pinturas de Karel Škréta aumentan el efectismo del interior del lugar.
Durante su estancia en Praga tocó el órgano de la iglesia Wolfgang Amadeus Mozart. También en actualidad se organizan conciertos en el sitio.
El campanario de la iglesia ofrece una vista a la Ciudad Pequeña de Praga y está abierto al público.